Несколько отдаленное будущее. Мутации уже не редкость, и как грибы появляются дети - их продукт, наделенные необычными способностями. Эти возможности делают их довольно опасными для остального человечества, и действие начинается в самый разгар борьбы в сенате за изгнание их из общества, изолируя их в специальных школах-заведениях. Конечно же, это не нравится собственно мутантам, пытающимся лишь жить как все обычные люди. Но не нравится несколько по-разному. С одной стороны находятся профессор Чарльз Ксавье со своей собственной школой для "одаренных" личностей, пытающийся убедить людей в безопасности мутаций, и опасный мутант Магнето, сколачивающий свою армию из суперлюдей, убежденный, что вскоре разразится настоящая война между людьми и мутантами. И как раз между этими группировками и попадают Росомаха и Бродяга, каждый из которых несет в себе необычные даже для мутантов силы.